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- Piezas anatomopatológicas humanas, distribuidas en dos pisos y sistematizadas por unidades temáticas y grandes procesos patológicos. Se encuentran expuestas prácticamente todas las patologías, en su evolución natural y patologías extinguidas o exóticas. (Viruela, Fiebre Amarilla etc.). Posee una importante colección sobre teratología y patología obstétrica como también piezas anatomopatológicas de origen animal, espontánea y experimental. Contamos con 2000 piezas expuestas y otro tanto en depósito.
- Instrumental Médico, fundamentalmente referido a la historia de la Patología.
- Archivo Histórico: Fondo documental sobre la historia departamental y del museo. Colecciones especiales correspondientes a P. I. Elizalde, J. Llambías, J. L. Monserrat, A. Murray, G. Bur, M. Guruceaga, entre otros. Protocolos de autopsias realizados en el Departamento de Patología desde el año 1898.
- Biblioteca Histórica nutrida con 2500 libros sobre Patología y Medicina en general. Libros italianos, alemanes y franceses donados por el Instituto Italiano de Cultura. Un gran número de ellos tienen una datación del siglo XIX.
- Tesis doctorales históricas.
- Hemeroteca histórica.
- Histoteca histórica y actual correspondientes a archivos de la Cátedra.
- Diapoteca.
- Colección fotográfica del área docente, fotos macroscópicas y microscópicas de autopsias.
- Videoteca sobre material histórico docente y paleopatología.
- Paneles educativos especialmente diseñados para contextualizar diversas temáticas.
- Colección de negativos en placas de vidrio de principios del siglo XX.
